A diferença para SATA-II (o correto é SATA 3.0Gb/s) é a largura de banda.
Os discos SATA trafegam sobre uma banda de 1.5Gb/s , já os novos, trafegam sobre 3.0Gb/s.
Parece uma grande vantagem mas, na verdade, não há nenhum ganho de performance inicial, pois a performance dos DISCOS ainda é a mesma.
Ou seja, se eles vão jogar seus dados sobre 1.5 ou 3.0, pouco importa, pois os dados saem dos discos a uma média de 60MB/s.
Conforme forem lançando novos modelos (com mais cache, gravação perpendicular, etc), aí sim os discos poderão tirar algum ganho da nova pista de tráfego dos dados.