Em Mega Man X Command Mission a Capcom quis inovar e criou um jogo com uma forte componente role-play. O resultado é muito interessante, porque alarga por completo o horizonte da série que agora pode até ter dois caminhos completamente diferentes: jogos de ação ou RPGs. Neste primeiro RPG, Mega Man, no controle do esquadrão de caça aos Mavericks, têm de penetrar um terrível laboratório que se localiza numa ilha artificial chamada Giga City. As batalhas serão realizadas como nos RPGs tradicionais, escolhendo comandos de um menu. A equipe de batalha é composta por até três personagens - além de X, Zero e Axl, quatro personagens inéditos entram na luta: Cinnamon, Marino, Masimo e Spider. Além de contar com habilidades únicas, todos podem ter seus equipamentos melhorados com o uso de itens chamados Force Metals. Sendo um RPG, ao longo do jogo vão existir alguns momentos um pouco parados, até porque iremos encontrar um monte de quadros e mais quadros cheios de informação. O laboratório é uma espécie de labirinto repleto de portas. | 
